Dinas Perhubungan Provinsi Kalimantan Timur menyelenggarakan layanan transportasi yang terbagi dalam dua bidang utama sesuai Renstra 2025–2029.

I. Transportasi Darat

• Pengadaan & pemasangan fasilitas perlengkapan jalan (rambu, marka, LPJU, pagar pengaman)
• Rekomendasi izin penyelenggaraan angkutan orang & barang (AKDP)
• Perpanjangan Kartu Pengawasan (KP) angkutan
• Penerbitan Surat Sertifikat Standar
• Penerbitan izin insidentil
• Rekomendasi Andalalin (Analisis Dampak Lalu Lintas)
• Rekomendasi MRLL (Manajemen Rekayasa Lalu Lintas)
• Izin perlintasan jalan / izin crossing
• Pengelolaan Terminal Tipe B (7 terminal di Kalimantan Timur)

II. Transportasi Sungai, Danau, Laut & Penyeberangan

• Izin usaha jasa pengurusan transportasi (SIUJPT)
• Izin usaha perusahaan bongkar muat (SIUPBM)
• Izin usaha angkutan laut pelayaran rakyat (Pelra)
• Izin usaha depo
• Persetujuan pengoperasian kapal angkutan sungai & danau
• Kartu pengawasan ijin trayek kapal sungai / speedboat antar Kab/Kota
• Izin trayek angkutan penyeberangan lintas Kab/Kota dalam provinsi
• Perizinan Standar Pelayanan Minimal angkutan penyeberangan
• Izin fasilitas penyeberangan angkutan khusus BBM/BBG di Pelabuhan Kariangau